ATCC細胞株作為科研工作者常用的工具，主要用于生物醫學研究的體外實驗研究。截止目前，被ATCC、JCRB、RIKEN、DSMZ*數據庫收錄的商用ATCC細胞株約為4000種左右。近年來，隨著ATCC細胞株的廣泛應用，ATCC細胞株被錯誤鑒定和交叉污染問題顯得尤為突出。為了確保實驗結果的可重復性，NIH和ATCC早年對此已發出呼吁，建議研究者對ATCC細胞株進行鑒定，以明確所使用細胞的身份。多種主流雜志也紛紛要求作者在投稿時提交ATCC細胞株鑒定報告，有些雜志甚至要求作者提供實驗前、實驗中和實驗后等不同階段的ATCC細胞株鑒定報告。
　　篩選ATCC細胞株的方法主要有哪些？
　　主要有三類方法：
　　1)單克隆環法：此類方法多用于整合率低的轉染方法或者需要得到單克隆ATCC細胞株的實驗。其優點在于工作量小，只需將轉染或者病毒載體感染后的細胞按照一定的細胞密度轉移至新皿中，并使用合適的藥物進行篩選，后在克隆環的幫助下對單克隆ATCC細胞株進行挑選，并在新皿中完成擴增。缺點在于需要對細胞密度和藥物濃度繪制致死曲線并選取合適的細胞密度和藥物濃度進行篩選，一些細小的密度和濃度差別都會導致難以獲取均一的單克隆，結果導致獲取的克隆不純，含有非整合的細胞。穩定整合的細胞在這樣一類混合細胞中，很快會失去生長優勢，終導致失去穩定株。 2)96孔單克隆稀釋法：此類方法同樣多用于整合率低的轉染方法或者需要得到單克隆ATCC細胞株以及篩選懸浮細胞穩定株的實驗。其優點在于，理論上可以得到非常均一的單克隆，同時可以篩選懸浮細胞穩定株。其缺點在于，工作量比較大。
　　3)逆轉錄病毒混合克隆制備法：此類方法適用于需要制備混合穩定株。優點在于可以在短時間內(1周)獲得穩定ATCC細胞株，同時也可以隨時將細胞稀釋轉移至新皿中獲得單克隆ATCC細胞株。缺點在于需要制備逆轉錄病毒載體。
　　ATCC細胞株需要具備在不同的時間，不同的場地以及不同的批次間生產相同質量產品的能力。在選定生產用ATCC細胞株之后，需要建立主細胞庫（mater cell bank）。從主細胞庫復蘇后，擴增建立工作細胞庫（working cell bank），工作細胞庫用于生產。細胞庫通常保存在液氮中，需要維持整個產品的生命周期。在構建生產用ATCC細胞株的過程中，宿主細胞和表達載體至關重要。